Vacuolen zijn kleurloze blaasvormige uitsparingen in het cytoplasma of kern van de cel en bevatten opgehoopt materiaal (afval). Vacuolen zijn een teken van verhoogde metabole of fagocytaire activiteit. Vacuolen kunnen ook ontstaan als artefact in oud materiaal door contact met EDTA.

Vacuolen komen veel voor in monocyten; ook in gezonde personen zijn meestal wel een aantal monocyten met vacuolen te vinden.