Auer Stäbchen werden traditionell mit (akuten) malignen Erkrankungen der myeloischen Abstammung in Verbindung gebracht. In sehr seltenen Fällen können sie jedoch auch bei lymphoiden Malignomen auftreten, wobei sie am häufigsten bei Plasmazelldyskrasien beschrieben werden. Die Kenntnisse über den Entstehungsmechanismus und die klinische Relevanz sind begrenzt, aber vermutlich beruhen sie auf der Kristallisation von lysosomalen Enzymen.