Les vacuoles sont des cavités incolores en forme de vessie dans le cytoplasme ou le noyau de la cellule et contiennent des matières accumulées (déchets). Les vacuoles sont le signe d'une activité métabolique ou phagocytaire accrue. Les vacuoles peuvent également se former en tant qu'artefacts dans le matériel ancien à la suite d'un contact avec l'EDTA.

Les vacuoles sont courantes dans les monocytes ; certains monocytes présentant des vacuoles peuvent également être trouvés chez des individus sains.